Die Pfarre Sillian, die zu den Altpfarren des Innicher Gebietes gehörte, hatte ungefähr das gleiche Ausmaß wie das heutige Dekanat.
Der erste Pfarrer war Engildinus im Jahre 1212. Die erste Kirche wurde 1326 geweiht, 1441 ein Kirchenneubau. Die gotische Marienstatue am Hochaltar (Sillian war ein Marienwallfahrtsort), der spitze Kirchturm und die Strebepfeiler stammen aus dem gotischen Bau. 1759/60 wurde die Kirche nach Westen verlängert und barockisiert. Deckengemälde und Altarblätter stammen vom Tiroler Hofkammermaler Josef Adam Mölck, die 14 Apostelstatuen vom Osttiroler Bildhauer Johann Patterer. 1893, 1930 und 1951 wurden Kirchenrenovierungen durchgeführt, außerdem wurde der Friedhof nach Westen erweitert. 1985 wurde die Empore abgetragen und eine mechanische Schleifladenorgel (Picher-Steinach) eingebaut. 1995/96 wurde die Kirche generalisiert. Ein Volksaltar nach Entwürfen des in Sillian geborenen Künstlers Jos Pirkner wurde errichtet. Die Nepomukstatue auf dem Giebel der Kirche und die Statue "Petrus Canisius" schnitze Josef Pranter aus Arnbach.